Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2IP36954 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms