Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA7P36544 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms