Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBSP35520 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBSP35520 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CBSP35520 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBSP35520 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBSP35520 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBSP35520 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CBSP35520 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBSP35520 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBSP35520 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBSP35520 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBSP35520 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBSP35520 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBSP35520 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBSP35520 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBSP35520 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBSP35520 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBSP35520 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBSP35520 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBSP35520 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBSP35520 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CBSP35520 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBSP35520 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBSP35520 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBSP35520 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBSP35520 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CBSP35520 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CBSP35520 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBSP35520 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBSP35520 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBSP35520 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBSP35520 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CBSP35520 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CBSP35520 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBSP35520 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBSP35520 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBSP35520 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBSP35520 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBSP35520 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBSP35520 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBSP35520 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBSP35520 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBSP35520 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBSP35520 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBSP35520 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBSP35520 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBSP35520 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBSP35520 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBSP35520 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBSP35520 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBSP35520 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBSP35520 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBSP35520 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBSP35520 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBSP35520 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBSP35520 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBSP35520 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBSP35520 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBSP35520 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBSP35520 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBSP35520 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBSP35520 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBSP35520 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBSP35520 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBSP35520 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBSP35520 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBSP35520 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms