Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA3P34903 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA3P34903 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms