Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 ARG8YOL140W 1272 nt6.03□□□□□ -1.44
NIC96P34077 COX15YER141W 1461 nt6.02□□□□□ -1.44
NIC96P34077 snR57snR57 88 nt6.02□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YER134CYER134C 537 nt6.02□□□□□ -1.45
NIC96P34077 SKI6YGR195W 741 nt6.02□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YJL215CYJL215C 360 nt6.02□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YLR402WYLR402W 192 nt6.02□□□□□ -1.45
NIC96P34077 MFA2YNL145W 117 nt6.02□□□□□ -1.45
NIC96P34077 MOD5YOR274W 1287 nt6.02□□□□□ -1.45
NIC96P34077 SEC62YPL094C 825 nt6.02□□□□□ -1.45
NIC96P34077 MPC54YOR177C 1395 nt6.02□□□□□ -1.45
NIC96P34077 PPR1YLR014C 2715 nt6.01□□□□□ -1.45
NIC96P34077 CCZ1YBR131W 2115 nt6.01□□□□□ -1.45
NIC96P34077 LDB7YBL006C 543 nt6.01□□□□□ -1.45
NIC96P34077 GSH2YOL049W 1476 nt6.01□□□□□ -1.45
NIC96P34077 MTC5YDR128W 3447 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 TKL1YPR074C 2043 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 INO2YDR123C 915 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 SEM1YDR363W-A 270 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YDR396WYDR396W 501 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 SUF16tG(GCC)C 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 EFM3YJR129C 1020 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 STB5YHR178W 2232 nt6□□□□□ -1.45
NIC96P34077 UTR2YEL040W 1404 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 ALT2YDR111C 1524 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 HEM1YDR232W 1647 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 ERC1YHR032W 1746 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 VPS36YLR417W 1701 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YHP1YDR451C 1062 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 CTR2YHR175W 570 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 LIA1YJR070C 978 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 HOC1YJR075W 1191 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YKL169CYKL169C 384 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YOR289WYOR289W 756 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 MRC1YCL061C 3291 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 BIO3YNR058W 1443 nt5.99□□□□□ -1.45
NIC96P34077 PLB3YOL011W 2061 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 GEX1YCL073C 1848 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YPT1YFL038C 621 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 ERV14YGL054C 417 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YGL262WYGL262W 528 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YGR066CYGR066C 879 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YKL107WYKL107W 930 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 MSA2YKR077W 1092 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YML133CYML133C 4125 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 ATG1YGL180W 2694 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 COQ1YBR003W 1422 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 MPP10YJR002W 1782 nt5.98□□□□□ -1.45
NIC96P34077 XBP1YIL101C 1944 nt5.97□□□□□ -1.45
NIC96P34077 NTE1YML059C 5040 nt5.97□□□□□ -1.45
NIC96P34077 DOT1YDR440W 1749 nt5.97□□□□□ -1.45
NIC96P34077 LSM6YDR378C 261 nt5.97□□□□□ -1.45
NIC96P34077 PSR1YLL010C 1284 nt5.97□□□□□ -1.45
NIC96P34077 YNL092WYNL092W 1203 nt5.97□□□□□ -1.45
NIC96P34077 RPS28AYOR167C 204 nt5.97□□□□□ -1.45
NIC96P34077 SET4YJL105W 1683 nt5.97□□□□□ -1.45
NIC96P34077 MIF2YKL089W 1650 nt5.97□□□□□ -1.45
NIC96P34077 BZZ1YHR114W 1902 nt5.97□□□□□ -1.45
NIC96P34077 COX10YPL172C 1389 nt5.96□□□□□ -1.45
NIC96P34077 SDA1YGR245C 2304 nt5.96□□□□□ -1.46
NIC96P34077 PFK2YMR205C 2880 nt5.96□□□□□ -1.46
NIC96P34077 FMP40YPL222W 2067 nt5.96□□□□□ -1.46
NIC96P34077 MED2YDL005C 1296 nt5.96□□□□□ -1.46
NIC96P34077 PFA5YDR459C 1125 nt5.96□□□□□ -1.46
NIC96P34077 YNL143CYNL143C 393 nt5.96□□□□□ -1.46
NIC96P34077 MPH3YJR160C 1809 nt5.96□□□□□ -1.46
NIC96P34077 EDE1YBL047C 4146 nt5.96□□□□□ -1.46
NIC96P34077 GCR2YNL199C 1605 nt5.96□□□□□ -1.46
NIC96P34077 LDB19YOR322C 2457 nt5.96□□□□□ -1.46
NIC96P34077 IXR1YKL032C 1794 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 GIP1YBR045C 1920 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 GPD1YDL022W 1176 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 RSM10YDR041W 612 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 STT3YGL022W 2157 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 PDE1YGL248W 1110 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 ICT1YLR099C 1185 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 YMR114CYMR114C 1107 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 KSH1YNL024C-A 219 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 FES1YBR101C 873 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 PEX3YDR329C 1326 nt5.95□□□□□ -1.46
NIC96P34077 YHK8YHR048W 1545 nt5.94□□□□□ -1.46
NIC96P34077 MAL13YGR288W 1422 nt5.94□□□□□ -1.46
NIC96P34077 PHM8YER037W 966 nt5.94□□□□□ -1.46
NIC96P34077 UIP3YAR027W 708 nt5.94□□□□□ -1.46
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