Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR2P33947 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms