Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3AP31941 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms