Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDI1P31150 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDI1P31150 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDI1P31150 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDI1P31150 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GDI1P31150 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDI1P31150 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDI1P31150 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDI1P31150 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDI1P31150 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDI1P31150 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDI1P31150 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDI1P31150 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDI1P31150 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDI1P31150 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDI1P31150 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDI1P31150 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GDI1P31150 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDI1P31150 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDI1P31150 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDI1P31150 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDI1P31150 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDI1P31150 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDI1P31150 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDI1P31150 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDI1P31150 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDI1P31150 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GDI1P31150 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDI1P31150 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDI1P31150 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDI1P31150 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDI1P31150 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GDI1P31150 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDI1P31150 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDI1P31150 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GDI1P31150 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GDI1P31150 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDI1P31150 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDI1P31150 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI1P31150 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI1P31150 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDI1P31150 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDI1P31150 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDI1P31150 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDI1P31150 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDI1P31150 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDI1P31150 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDI1P31150 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDI1P31150 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDI1P31150 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDI1P31150 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GDI1P31150 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDI1P31150 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDI1P31150 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDI1P31150 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDI1P31150 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDI1P31150 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDI1P31150 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDI1P31150 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDI1P31150 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDI1P31150 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDI1P31150 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI1P31150 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI1P31150 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI1P31150 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI1P31150 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI1P31150 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI1P31150 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI1P31150 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI1P31150 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI1P31150 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDI1P31150 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDI1P31150 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDI1P31150 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDI1P31150 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDI1P31150 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDI1P31150 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms