Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EPHA3P29320 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms