Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO1P25800 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO1P25800 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO1P25800 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMO1P25800 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMO1P25800 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMO1P25800 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMO1P25800 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMO1P25800 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMO1P25800 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMO1P25800 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMO1P25800 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMO1P25800 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMO1P25800 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMO1P25800 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMO1P25800 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMO1P25800 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMO1P25800 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMO1P25800 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMO1P25800 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMO1P25800 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMO1P25800 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMO1P25800 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMO1P25800 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMO1P25800 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LMO1P25800 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMO1P25800 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMO1P25800 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMO1P25800 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMO1P25800 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMO1P25800 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMO1P25800 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMO1P25800 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LMO1P25800 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMO1P25800 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMO1P25800 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMO1P25800 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMO1P25800 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMO1P25800 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMO1P25800 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMO1P25800 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMO1P25800 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMO1P25800 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMO1P25800 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMO1P25800 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMO1P25800 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMO1P25800 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMO1P25800 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LMO1P25800 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMO1P25800 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMO1P25800 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMO1P25800 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMO1P25800 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMO1P25800 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMO1P25800 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMO1P25800 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LMO1P25800 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMO1P25800 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMO1P25800 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMO1P25800 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMO1P25800 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMO1P25800 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LMO1P25800 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LMO1P25800 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LMO1P25800 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LMO1P25800 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMO1P25800 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMO1P25800 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMO1P25800 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMO1P25800 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMO1P25800 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMO1P25800 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMO1P25800 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMO1P25800 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LMO1P25800 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMO1P25800 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMO1P25800 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMO1P25800 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMO1P25800 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMO1P25800 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMO1P25800 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMO1P25800 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LMO1P25800 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LMO1P25800 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LMO1P25800 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMO1P25800 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LMO1P25800 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms