Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPREP23469 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPREP23469 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPREP23469 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPREP23469 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPREP23469 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPREP23469 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPREP23469 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPREP23469 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPREP23469 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPREP23469 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPREP23469 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPREP23469 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPREP23469 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPREP23469 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPREP23469 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPREP23469 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPREP23469 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPREP23469 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPREP23469 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPREP23469 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPREP23469 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPREP23469 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPREP23469 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPREP23469 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPREP23469 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPREP23469 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPREP23469 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPREP23469 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPREP23469 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPREP23469 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPREP23469 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPREP23469 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPREP23469 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPREP23469 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPREP23469 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPREP23469 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPREP23469 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPREP23469 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPREP23469 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPREP23469 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPREP23469 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPREP23469 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPREP23469 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPREP23469 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPREP23469 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPREP23469 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPREP23469 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPREP23469 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPREP23469 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPREP23469 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPREP23469 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPREP23469 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPREP23469 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPREP23469 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPREP23469 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPREP23469 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPREP23469 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPREP23469 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPREP23469 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPREP23469 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPREP23469 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPREP23469 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPREP23469 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPREP23469 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPREP23469 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPREP23469 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPREP23469 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPREP23469 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPREP23469 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPREP23469 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPREP23469 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPREP23469 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPREP23469 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPREP23469 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPREP23469 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPREP23469 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPREP23469 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPREP23469 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPREP23469 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPREP23469 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPREP23469 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPREP23469 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPREP23469 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPREP23469 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPREP23469 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPREP23469 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPREP23469 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms