Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTF3P20783 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTF3P20783 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTF3P20783 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTF3P20783 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF3P20783 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF3P20783 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF3P20783 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF3P20783 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTF3P20783 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTF3P20783 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTF3P20783 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTF3P20783 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NTF3P20783 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTF3P20783 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NTF3P20783 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTF3P20783 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTF3P20783 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTF3P20783 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTF3P20783 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTF3P20783 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTF3P20783 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTF3P20783 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTF3P20783 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF3P20783 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF3P20783 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF3P20783 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF3P20783 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF3P20783 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF3P20783 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms