Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB5AP20339 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms