Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCN1P20061 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCN1P20061 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCN1P20061 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN1P20061 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN1P20061 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN1P20061 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN1P20061 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN1P20061 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN1P20061 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN1P20061 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN1P20061 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN1P20061 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN1P20061 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCN1P20061 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCN1P20061 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCN1P20061 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCN1P20061 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCN1P20061 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCN1P20061 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCN1P20061 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCN1P20061 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCN1P20061 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCN1P20061 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCN1P20061 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCN1P20061 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCN1P20061 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN1P20061 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN1P20061 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN1P20061 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN1P20061 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN1P20061 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN1P20061 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN1P20061 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN1P20061 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN1P20061 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN1P20061 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN1P20061 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN1P20061 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN1P20061 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN1P20061 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCN1P20061 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCN1P20061 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN1P20061 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN1P20061 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN1P20061 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN1P20061 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN1P20061 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN1P20061 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN1P20061 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN1P20061 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN1P20061 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCN1P20061 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCN1P20061 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCN1P20061 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCN1P20061 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCN1P20061 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCN1P20061 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN1P20061 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN1P20061 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN1P20061 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN1P20061 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN1P20061 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN1P20061 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN1P20061 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN1P20061 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN1P20061 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN1P20061 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN1P20061 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN1P20061 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN1P20061 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN1P20061 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN1P20061 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN1P20061 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN1P20061 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN1P20061 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN1P20061 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN1P20061 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms