Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2B1P20020 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2B1P20020 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms