Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT4P19013 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT4P19013 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT4P19013 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT4P19013 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT4P19013 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT4P19013 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT4P19013 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT4P19013 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT4P19013 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT4P19013 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT4P19013 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT4P19013 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT4P19013 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT4P19013 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT4P19013 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT4P19013 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT4P19013 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT4P19013 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT4P19013 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT4P19013 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT4P19013 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT4P19013 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT4P19013 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT4P19013 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT4P19013 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT4P19013 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT4P19013 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT4P19013 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT4P19013 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT4P19013 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT4P19013 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT4P19013 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT4P19013 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT4P19013 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT4P19013 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT4P19013 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT4P19013 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT4P19013 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT4P19013 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT4P19013 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT4P19013 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT4P19013 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT4P19013 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT4P19013 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT4P19013 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT4P19013 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT4P19013 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT4P19013 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT4P19013 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT4P19013 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT4P19013 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT4P19013 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT4P19013 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT4P19013 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT4P19013 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT4P19013 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT4P19013 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT4P19013 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT4P19013 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT4P19013 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT4P19013 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT4P19013 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT4P19013 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT4P19013 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT4P19013 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT4P19013 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT4P19013 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT4P19013 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT4P19013 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT4P19013 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT4P19013 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT4P19013 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT4P19013 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT4P19013 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT4P19013 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms