Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC2P18074 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms