Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKLP17858 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKLP17858 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKLP17858 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PFKLP17858 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKLP17858 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKLP17858 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKLP17858 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFKLP17858 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKLP17858 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKLP17858 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKLP17858 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKLP17858 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKLP17858 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKLP17858 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFKLP17858 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKLP17858 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKLP17858 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKLP17858 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKLP17858 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKLP17858 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKLP17858 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFKLP17858 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PFKLP17858 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKLP17858 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKLP17858 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKLP17858 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKLP17858 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKLP17858 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFKLP17858 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKLP17858 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKLP17858 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKLP17858 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKLP17858 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKLP17858 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKLP17858 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKLP17858 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKLP17858 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFKLP17858 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFKLP17858 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFKLP17858 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFKLP17858 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKLP17858 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKLP17858 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFKLP17858 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKLP17858 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKLP17858 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKLP17858 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKLP17858 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKLP17858 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKLP17858 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFKLP17858 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFKLP17858 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKLP17858 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKLP17858 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKLP17858 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKLP17858 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKLP17858 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKLP17858 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKLP17858 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKLP17858 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFKLP17858 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFKLP17858 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFKLP17858 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFKLP17858 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFKLP17858 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PFKLP17858 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PFKLP17858 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKLP17858 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKLP17858 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKLP17858 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKLP17858 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKLP17858 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKLP17858 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKLP17858 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFKLP17858 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms