Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOT1P17174 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOT1P17174 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOT1P17174 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOT1P17174 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOT1P17174 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOT1P17174 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1P17174 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1P17174 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1P17174 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1P17174 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1P17174 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1P17174 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1P17174 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1P17174 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOT1P17174 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOT1P17174 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOT1P17174 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOT1P17174 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOT1P17174 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOT1P17174 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOT1P17174 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOT1P17174 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOT1P17174 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOT1P17174 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOT1P17174 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOT1P17174 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOT1P17174 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOT1P17174 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOT1P17174 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOT1P17174 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOT1P17174 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOT1P17174 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOT1P17174 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOT1P17174 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOT1P17174 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOT1P17174 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOT1P17174 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GOT1P17174 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOT1P17174 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOT1P17174 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOT1P17174 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOT1P17174 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOT1P17174 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOT1P17174 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOT1P17174 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOT1P17174 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOT1P17174 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOT1P17174 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOT1P17174 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1P17174 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1P17174 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1P17174 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1P17174 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1P17174 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1P17174 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOT1P17174 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOT1P17174 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOT1P17174 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOT1P17174 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GOT1P17174 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOT1P17174 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GOT1P17174 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOT1P17174 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOT1P17174 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOT1P17174 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOT1P17174 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOT1P17174 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOT1P17174 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOT1P17174 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GOT1P17174 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1P17174 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1P17174 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1P17174 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1P17174 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1P17174 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1P17174 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1P17174 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOT1P17174 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1P17174 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1P17174 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1P17174 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1P17174 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1P17174 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1P17174 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1P17174 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1P17174 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1P17174 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOT1P17174 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT1P17174 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT1P17174 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT1P17174 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOT1P17174 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT1P17174 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT1P17174 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT1P17174 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT1P17174 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT1P17174 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT1P17174 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOT1P17174 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms