Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPCAMP16422 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPCAMP16422 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPCAMP16422 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms