Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCK1P16333 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCK1P16333 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCK1P16333 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCK1P16333 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCK1P16333 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCK1P16333 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCK1P16333 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCK1P16333 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCK1P16333 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCK1P16333 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCK1P16333 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCK1P16333 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCK1P16333 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCK1P16333 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCK1P16333 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCK1P16333 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCK1P16333 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCK1P16333 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCK1P16333 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCK1P16333 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCK1P16333 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCK1P16333 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCK1P16333 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCK1P16333 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCK1P16333 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCK1P16333 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCK1P16333 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCK1P16333 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCK1P16333 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCK1P16333 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCK1P16333 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCK1P16333 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCK1P16333 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCK1P16333 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCK1P16333 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCK1P16333 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCK1P16333 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCK1P16333 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCK1P16333 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCK1P16333 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCK1P16333 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCK1P16333 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCK1P16333 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCK1P16333 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCK1P16333 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCK1P16333 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCK1P16333 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCK1P16333 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCK1P16333 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCK1P16333 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCK1P16333 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCK1P16333 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCK1P16333 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCK1P16333 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCK1P16333 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCK1P16333 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCK1P16333 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCK1P16333 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCK1P16333 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCK1P16333 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCK1P16333 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCK1P16333 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCK1P16333 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCK1P16333 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCK1P16333 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCK1P16333 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCK1P16333 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCK1P16333 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCK1P16333 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCK1P16333 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCK1P16333 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms