Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRP12270 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRP12270 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPRP12270 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRP12270 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPRP12270 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPRP12270 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRP12270 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRP12270 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRP12270 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRP12270 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRP12270 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRP12270 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPRP12270 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRP12270 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRP12270 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRP12270 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRP12270 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPRP12270 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRP12270 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRP12270 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRP12270 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRP12270 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRP12270 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRP12270 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRP12270 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPRP12270 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRP12270 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRP12270 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRP12270 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRP12270 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRP12270 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPRP12270 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRP12270 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRP12270 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRP12270 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRP12270 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRP12270 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRP12270 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRP12270 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRP12270 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRP12270 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRP12270 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRP12270 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRP12270 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRP12270 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRP12270 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRP12270 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRP12270 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPRP12270 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRP12270 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRP12270 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRP12270 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRP12270 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRP12270 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRP12270 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRP12270 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRP12270 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRP12270 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRP12270 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRP12270 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRP12270 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRP12270 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRP12270 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRP12270 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRP12270 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRP12270 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRP12270 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRP12270 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRP12270 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRP12270 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRP12270 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRP12270 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRP12270 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRP12270 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRP12270 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRP12270 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRP12270 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRP12270 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRP12270 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRP12270 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRP12270 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRP12270 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRP12270 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRP12270 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRP12270 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRP12270 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRP12270 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRP12270 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms