Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HARSP12081 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HARSP12081 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HARSP12081 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HARSP12081 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HARSP12081 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HARSP12081 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HARSP12081 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HARSP12081 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HARSP12081 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HARSP12081 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HARSP12081 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HARSP12081 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HARSP12081 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HARSP12081 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HARSP12081 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HARSP12081 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HARSP12081 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HARSP12081 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HARSP12081 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HARSP12081 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HARSP12081 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HARSP12081 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HARSP12081 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HARSP12081 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HARSP12081 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HARSP12081 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HARSP12081 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HARSP12081 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HARSP12081 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HARSP12081 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HARSP12081 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HARSP12081 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HARSP12081 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HARSP12081 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HARSP12081 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HARSP12081 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HARSP12081 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HARSP12081 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HARSP12081 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HARSP12081 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HARSP12081 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HARSP12081 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HARSP12081 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HARSP12081 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HARSP12081 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HARSP12081 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HARSP12081 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HARSP12081 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HARSP12081 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HARSP12081 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HARSP12081 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HARSP12081 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HARSP12081 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HARSP12081 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HARSP12081 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HARSP12081 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HARSP12081 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HARSP12081 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HARSP12081 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HARSP12081 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HARSP12081 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HARSP12081 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HARSP12081 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HARSP12081 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HARSP12081 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HARSP12081 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HARSP12081 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HARSP12081 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HARSP12081 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HARSP12081 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HARSP12081 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HARSP12081 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HARSP12081 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HARSP12081 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HARSP12081 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HARSP12081 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HARSP12081 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HARSP12081 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HARSP12081 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HARSP12081 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HARSP12081 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HARSP12081 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HARSP12081 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HARSP12081 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HARSP12081 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HARSP12081 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HARSP12081 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HARSP12081 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HARSP12081 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms