Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC192P0DO97 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms