Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC175P0C221 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms