Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXB5P09067 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB5P09067 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB5P09067 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms