Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT19P08727 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT19P08727 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT19P08727 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT19P08727 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT19P08727 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT19P08727 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT19P08727 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT19P08727 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT19P08727 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT19P08727 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT19P08727 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT19P08727 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT19P08727 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT19P08727 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT19P08727 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT19P08727 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT19P08727 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT19P08727 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT19P08727 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT19P08727 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT19P08727 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT19P08727 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT19P08727 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT19P08727 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT19P08727 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT19P08727 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT19P08727 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT19P08727 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT19P08727 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT19P08727 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT19P08727 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT19P08727 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT19P08727 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT19P08727 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT19P08727 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT19P08727 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT19P08727 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT19P08727 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT19P08727 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT19P08727 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT19P08727 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT19P08727 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT19P08727 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT19P08727 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT19P08727 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT19P08727 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT19P08727 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT19P08727 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT19P08727 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT19P08727 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT19P08727 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT19P08727 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT19P08727 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT19P08727 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT19P08727 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT19P08727 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT19P08727 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT19P08727 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT19P08727 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT19P08727 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT19P08727 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT19P08727 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT19P08727 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT19P08727 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT19P08727 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT19P08727 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT19P08727 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT19P08727 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT19P08727 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT19P08727 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT19P08727 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT19P08727 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT19P08727 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT19P08727 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT19P08727 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT19P08727 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT19P08727 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT19P08727 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT19P08727 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT19P08727 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT19P08727 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT19P08727 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT19P08727 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT19P08727 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT19P08727 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT19P08727 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT19P08727 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT19P08727 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT19P08727 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms