Protein–RNA interactions for Protein: P08559

PDHA1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDHA1P08559 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDHA1P08559 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDHA1P08559 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDHA1P08559 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms