Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MGPP08493 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MGPP08493 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MGPP08493 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MGPP08493 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MGPP08493 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MGPP08493 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MGPP08493 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MGPP08493 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MGPP08493 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MGPP08493 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MGPP08493 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MGPP08493 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MGPP08493 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MGPP08493 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MGPP08493 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MGPP08493 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MGPP08493 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MGPP08493 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MGPP08493 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MGPP08493 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MGPP08493 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MGPP08493 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MGPP08493 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MGPP08493 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
MGPP08493 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MGPP08493 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MGPP08493 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MGPP08493 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MGPP08493 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MGPP08493 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MGPP08493 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MGPP08493 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MGPP08493 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MGPP08493 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MGPP08493 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MGPP08493 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MGPP08493 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MGPP08493 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MGPP08493 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MGPP08493 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MGPP08493 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MGPP08493 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms