Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DQB2P05538 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQB2P05538 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms