Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A1P02730 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A1P02730 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A1P02730 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A1P02730 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms