Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHAP00338 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDHAP00338 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDHAP00338 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDHAP00338 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDHAP00338 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHAP00338 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHAP00338 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHAP00338 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHAP00338 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHAP00338 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHAP00338 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHAP00338 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHAP00338 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHAP00338 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHAP00338 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHAP00338 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHAP00338 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHAP00338 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHAP00338 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHAP00338 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHAP00338 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHAP00338 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHAP00338 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHAP00338 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHAP00338 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHAP00338 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHAP00338 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHAP00338 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDHAP00338 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDHAP00338 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHAP00338 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHAP00338 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHAP00338 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDHAP00338 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDHAP00338 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDHAP00338 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDHAP00338 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDHAP00338 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDHAP00338 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDHAP00338 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDHAP00338 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDHAP00338 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDHAP00338 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDHAP00338 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDHAP00338 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDHAP00338 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHAP00338 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHAP00338 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHAP00338 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHAP00338 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHAP00338 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHAP00338 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHAP00338 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHAP00338 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDHAP00338 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHAP00338 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHAP00338 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHAP00338 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHAP00338 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDHAP00338 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHAP00338 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHAP00338 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHAP00338 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHAP00338 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHAP00338 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHAP00338 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHAP00338 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHAP00338 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHAP00338 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDHAP00338 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHAP00338 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHAP00338 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHAP00338 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHAP00338 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHAP00338 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDHAP00338 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHAP00338 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHAP00338 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHAP00338 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHAP00338 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDHAP00338 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHAP00338 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHAP00338 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHAP00338 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHAP00338 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHAP00338 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDHAP00338 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHAP00338 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHAP00338 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHAP00338 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHAP00338 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDHAP00338 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHAP00338 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHAP00338 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHAP00338 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDHAP00338 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDHAP00338 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDHAP00338 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDHAP00338 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms