Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4BO95155 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE4BO95155 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms