Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DKK1O94907 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK1O94907 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK1O94907 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DKK1O94907 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DKK1O94907 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DKK1O94907 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DKK1O94907 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DKK1O94907 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DKK1O94907 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DKK1O94907 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DKK1O94907 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DKK1O94907 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK1O94907 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK1O94907 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK1O94907 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DKK1O94907 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK1O94907 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK1O94907 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK1O94907 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK1O94907 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK1O94907 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK1O94907 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK1O94907 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DKK1O94907 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK1O94907 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK1O94907 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK1O94907 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DKK1O94907 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK1O94907 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK1O94907 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK1O94907 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK1O94907 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK1O94907 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DKK1O94907 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK1O94907 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK1O94907 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK1O94907 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK1O94907 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK1O94907 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK1O94907 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK1O94907 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DKK1O94907 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK1O94907 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK1O94907 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK1O94907 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK1O94907 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK1O94907 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK1O94907 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK1O94907 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DKK1O94907 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DKK1O94907 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK1O94907 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK1O94907 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK1O94907 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK1O94907 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK1O94907 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK1O94907 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK1O94907 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK1O94907 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK1O94907 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DKK1O94907 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK1O94907 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK1O94907 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK1O94907 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK1O94907 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK1O94907 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms