Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCC1O94876 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMCC1O94876 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms