Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP2O75563 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKAP2O75563 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms