Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSDE1O75534 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSDE1O75534 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CSDE1O75534 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms