Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMPCBO75439 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCBO75439 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMPCBO75439 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms