Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX3O75364 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX3O75364 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX3O75364 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX3O75364 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX3O75364 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX3O75364 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX3O75364 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX3O75364 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX3O75364 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX3O75364 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX3O75364 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX3O75364 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX3O75364 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX3O75364 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX3O75364 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX3O75364 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX3O75364 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX3O75364 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX3O75364 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX3O75364 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX3O75364 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX3O75364 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX3O75364 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX3O75364 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX3O75364 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX3O75364 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX3O75364 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX3O75364 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX3O75364 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX3O75364 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX3O75364 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms