Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KIAA0556O60303 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
KIAA0556O60303 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
KIAA0556O60303 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
KIAA0556O60303 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
KIAA0556O60303 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms