Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATCO43716 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATCO43716 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATCO43716 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATCO43716 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GATCO43716 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATCO43716 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATCO43716 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATCO43716 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATCO43716 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATCO43716 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATCO43716 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATCO43716 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATCO43716 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATCO43716 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATCO43716 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATCO43716 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATCO43716 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATCO43716 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATCO43716 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATCO43716 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATCO43716 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATCO43716 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATCO43716 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATCO43716 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATCO43716 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATCO43716 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATCO43716 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATCO43716 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATCO43716 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATCO43716 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATCO43716 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATCO43716 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATCO43716 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATCO43716 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATCO43716 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATCO43716 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATCO43716 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATCO43716 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATCO43716 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATCO43716 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms