Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP2AO43633 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP2AO43633 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP2AO43633 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP2AO43633 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms