Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNAB3O43448 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNAB3O43448 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNAB3O43448 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNAB3O43448 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNAB3O43448 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNAB3O43448 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNAB3O43448 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNAB3O43448 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNAB3O43448 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms