Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSI1O43347 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSI1O43347 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSI1O43347 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MSI1O43347 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSI1O43347 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSI1O43347 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSI1O43347 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSI1O43347 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MSI1O43347 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSI1O43347 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSI1O43347 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSI1O43347 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSI1O43347 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSI1O43347 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSI1O43347 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSI1O43347 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSI1O43347 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSI1O43347 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSI1O43347 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSI1O43347 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSI1O43347 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MSI1O43347 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MSI1O43347 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSI1O43347 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSI1O43347 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSI1O43347 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSI1O43347 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSI1O43347 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSI1O43347 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSI1O43347 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSI1O43347 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSI1O43347 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSI1O43347 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSI1O43347 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSI1O43347 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSI1O43347 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSI1O43347 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSI1O43347 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSI1O43347 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSI1O43347 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSI1O43347 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSI1O43347 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MSI1O43347 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSI1O43347 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSI1O43347 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSI1O43347 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSI1O43347 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSI1O43347 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSI1O43347 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSI1O43347 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSI1O43347 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSI1O43347 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSI1O43347 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MSI1O43347 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSI1O43347 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSI1O43347 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSI1O43347 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSI1O43347 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSI1O43347 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSI1O43347 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI1O43347 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI1O43347 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI1O43347 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI1O43347 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI1O43347 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI1O43347 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI1O43347 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI1O43347 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI1O43347 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSI1O43347 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSI1O43347 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSI1O43347 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSI1O43347 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSI1O43347 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSI1O43347 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms