Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTSS1O43312 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTSS1O43312 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTSS1O43312 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms