Protein–RNA interactions for Protein: O15126

SCAMP1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1O15126 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP1O15126 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAMP1O15126 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP1O15126 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms