Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOCS3O14543 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS3O14543 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms