Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBAG9O00559 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBAG9O00559 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBAG9O00559 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms