Protein–RNA interactions for Protein: J3QT63

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QT63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QT63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QT63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QT63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QT63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QT63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QT63 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QT63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QT63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QT63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QT63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QT63 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QT63 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QT63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QT63 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QT63 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QT63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QT63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QT63 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QT63 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QT63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QT63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QT63 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QT63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QT63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QT63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QT63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QT63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QT63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QT63 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QT63 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QT63 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QT63 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QT63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QT63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QT63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QT63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QT63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QT63 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QT63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QT63 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QT63 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QT63 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QT63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QT63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QT63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QT63 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QT63 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QT63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QT63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QT63 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QT63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QT63 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QT63 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QT63 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QT63 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QT63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QT63 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QT63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QT63 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QT63 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QT63 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QT63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QT63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QT63 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QT63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QT63 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QT63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QT63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QT63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3QT63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3QT63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3QT63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QT63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QT63 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QT63 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QT63 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QT63 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QT63 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms