Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CCER2I3L3R5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCER2I3L3R5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCER2I3L3R5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCER2I3L3R5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms